La storia è ambientata 10.000 anni prima dell’ascensione di Paul Atreides. Dune: Prophecy segue due sorelle Harkonnen mentre combattono le forze che minacciano il futuro dell’umanità e fondano la setta che diventerà nota come Bene Gesserit. Lo show è ispirato al romanzo Sisterhood of Dune, scritto da Brian Herbert e Kevin J. Anderson, e la prima stagione è composta da sei episodi. La serie, infatti, era originariamente intitolata Dune: The Sisterhood.