Il 4 settembre Papa Francesco è stato accolto dalla folla che sventolava bandierine del Vaticano e dell'Indonesia all'arrivo della sua auto al Palazzo Presidenziale Merdeka di Giacarta. Il pontefice ha incontrato il presidente indonesiano Joko Widodo all'esterno dell'edificio. I due leader sono stati salutati da una guardia d'onore che ha suonato gli inni indonesiano e vaticano, prima di proseguire con un incontro privato. Il ministro degli Esteri indonesiano Retno Marsudi ha riferito che durante l'incontro non si è parlato nello specifico della guerra tra Israele e Gaza, ma più in generale dei conflitti in corso e "dell'importanza della pace". L’Indonesia è la prima tappa del viaggio del Papa in Asia e Oceania, che terminerà il 14 settembre.